RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q8IZM0	81 aa		10.36	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.35	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		10.34	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	HBD	P02042	147 aa		10.34	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BRM9	83 aa		10.32	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL5	P42830	114 aa		10.32	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		10.32	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035		F8VRH5	84 aa		10.31	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP5L	O75964	103 aa		10.31	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.31	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.3	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX7B2	Q8TF08	81 aa		10.3	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.29	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.29	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.29	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.29	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A096LNJ9	63 aa		10.28	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.28	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.28	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf137	Q5JT78	98 aa		10.27	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAGE3	Q86Y29	109 aa		10.27	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		10.27	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.26	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2B	P63146	152 aa		10.26	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	REG3G	Q6UW15	175 aa		10.26	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.25	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0QXV9	152 aa		10.25	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.24	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.24	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSBP1	O75506	76 aa		10.23	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRGC2	P03986	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.22	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.21	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.2	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.19	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	C22orf24	Q9Y442	160 aa		10.19	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.18	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf86	A6NJI1	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV7-43	P04211	117 aa		10.18	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.18	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT1HL1	P0DM35	61 aa		10.17	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIRC1	Q969H9	104 aa		10.17	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PFN2	P35080	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.16	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		10.15	□□□□□ -0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	COLCA2	A8K830	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0Y8G0	127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERF1A	O75920	110 aa		10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.13	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERC1	Q15751	4861 aa		10.12	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUPR1	O60356	82 aa		10.12	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX17	Q14061	63 aa		10.12	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ODF1	Q14990	250 aa		10.11	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.11	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM223	A0PJW6	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0Y9J4	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	FABP4	P15090	132 aa		10.09	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V1G1	O75348	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00158	P58513	81 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		10.08	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		10.06	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.06	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF861P	O60384	105 aa		10.06	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.05	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLN	P26678	52 aa		10.05	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00310	P59036	64 aa		10.05	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0U1RRA0	63 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00587	B1AMM8	73 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCE1	O60756	84 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCO1	O75880	301 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERV-K104	P63124	156 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.04	□□□□□ -0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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