RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 C10orf25Q5T742 122 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 C2orf82Q6UX34 121 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 Q8IZM0 81 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 STPG4Q8N801 248 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.84□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 LCE2BO14633 110 aa5.84□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.84□□□□□ -1.47
NELFE-214ENST00000625905 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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NELFE-214ENST00000625905 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.83□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 F8VRH5 84 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.81□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 LEPROTL1O95214 131 aa5.81□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.81□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 H0Y8G0 127 aa5.8□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.8□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.79□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 HIST1H2BJP06899 126 aa5.79□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.79□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PNN7 141 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 NUPR1O60356 82 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-214ENST00000625905 FABP4P15090 132 aa5.78□□□□□ -1.48
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NELFE-214ENST00000625905 SFTA2Q6UW10 78 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 M0QXV9 152 aa5.75□□□□□ -1.49
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NELFE-214ENST00000625905 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.75□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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NELFE-214ENST00000625905 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 ERG28Q9UKR5 140 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 PFN2P35080 140 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 HERVK_113P61574 105 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 UBE2BP63146 152 aa5.73□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 IGKCP01834 107 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFE-214ENST00000625905 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.72□□□□□ -1.49
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NELFE-214ENST00000625905 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 COX17Q14061 63 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 C1orf137Q5JT78 98 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.71□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 HERV-K104P63124 156 aa5.7□□□□□ -1.5
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NELFE-214ENST00000625905 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.7□□□□□ -1.5
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NELFE-214ENST00000625905 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LEPROTO15243 131 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 LINC00158P58513 81 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-214ENST00000625905 KRTDAPP60985 99 aa5.69□□□□□ -1.5
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