RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619998.1

GGTLC3-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GGTLC3, Length 968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3-201ENST00000619998 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 ATP5LO75964 103 aa13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 A0A1W2PNN7 141 aa13□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 Q6ZRP5 223 aa13□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa12.99□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.99□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.99□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 CXCL5P42830 114 aa12.99□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 PMCHL1Q16048 86 aa12.99□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 HERC1Q15751 4861 aa12.98□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 H3BRM9 83 aa12.97□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 OXTP01178 125 aa12.97□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 IGLC3P0DOY3 106 aa12.97□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 NDUFA6P56556 154 aa12.97□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 F8VRH5 84 aa12.96□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 TRGC2P03986 189 aa12.96□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
GGTLC3-201ENST00000619998 J3QL48 77 aa12.95□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 GAGE2EQ4V326 116 aa12.95□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.95□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 COX7B2Q8TF08 81 aa12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 FAT3Q8TDW7 4589 aa12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 BAGE3Q86Y29 109 aa12.93□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 COLCA2A8K830 154 aa12.92□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 SPINK8P0C7L1 97 aa12.92□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 HSBP1O75506 76 aa12.91□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
GGTLC3-201ENST00000619998 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.89□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 FAM168BA1KXE4 195 aa12.89□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.89□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 C11orf86A6NJI1 115 aa12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 ODF1Q14990 250 aa12.85□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.85□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.85□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.85□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.85□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.84□□□□□ -0.35
GGTLC3-201ENST00000619998 M0QXV9 152 aa12.83□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 SERF1AO75920 110 aa12.83□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 LINC00310P59036 64 aa12.82□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 SFTA2Q6UW10 78 aa12.82□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.82□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 LEPROTL1O95214 131 aa12.8□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 C1orf137Q5JT78 98 aa12.79□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.78□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.78□□□□□ -0.36
GGTLC3-201ENST00000619998 TMEM223A0PJW6 202 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 SCO1O75880 301 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 UBE2BP63146 152 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 C22orf24Q9Y442 160 aa12.77□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 NUPR1O60356 82 aa12.76□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 COX17Q14061 63 aa12.76□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 REG3GQ6UW15 175 aa12.76□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.76□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 IGLV7-43P04211 117 aa12.74□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 LINC01600Q96MT4 127 aa12.74□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 ERG28Q9UKR5 140 aa12.74□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 MT1HL1P0DM35 61 aa12.73□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 PFN2P35080 140 aa12.73□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BKO60814 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BJP06899 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 FABP4P15090 132 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BOP23527 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BBP33778 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BDP58876 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BCP62807 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.71□□□□□ -0.37
GGTLC3-201ENST00000619998 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.7□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 H0Y8G0 127 aa12.7□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 PLNP26678 52 aa12.7□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 DIRC1Q969H9 104 aa12.69□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.68□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.67□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 DPM2O94777 84 aa12.66□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.66□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 HERV-K104P63124 156 aa12.65□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 LINC00167Q96N53 147 aa12.65□□□□□ -0.38
GGTLC3-201ENST00000619998 TNXBP22105 4242 aa12.64□□□□□ -0.39
GGTLC3-201ENST00000619998 LINC00587B1AMM8 73 aa12.63□□□□□ -0.39
GGTLC3-201ENST00000619998 H0Y9J4 135 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms