RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERC2-IT1O76042 136 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ESM1Q9NQ30 184 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.09□□□□□ -1.91
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AKAP6Q13023 2319 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATRXP46100 2492 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 A0A0J9YWU9 116 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGLV6-57P01721 117 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 Q6ZVQ6 151 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C20orf197Q8N268 126 aa3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LRBAP50851 2863 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCL24O00175 119 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C6orf99Q4VX62 202 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C16orf95Q9H693 158 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRO0628Q9UI54 55 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CR1P17927 2039 aa3.07□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGLV1-51P01701 117 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 Q8NDZ9 215 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CELA1Q9UNI1 258 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATMQ13315 3056 aa3.06□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NBASA2RRP1 2371 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 M0R2N4 97 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GYPEP15421 78 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRO0255Q9UI72 69 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAST4O15021 2626 aa3.05□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 A0A1B0GW54 56 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HAMPP81172 84 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 Q8N3U1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RMI2Q96E14 147 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CREBBPQ92793 2442 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 A0A0U1RQV1 116 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LYRM9A8MSI8 78 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 F8WEM9 126 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MIFP14174 115 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 COX7BP24311 80 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 REG3AQ06141 175 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 Q6ZQY7 126 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF843Q8N446 348 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC01006Q8NI28 216 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OCR1Q9BZK8 76 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRR34Q9NV39 138 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 X6R8D5 127 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LCE6AA0A183 80 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BPY2O14599 106 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NREPQ16612 68 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C10orf25Q5T742 122 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DIRC1Q969H9 104 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 F8WDY8 70 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGKV4-1P06312 121 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DEFB130BP0DP73 79 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DEFB130AP0DP74 79 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SPAG11BQ08648 103 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LELP1Q5T871 98 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 Q6ZTC4 211 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms