RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 PCOTHQ58A44 107 aa8.47□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 C2orf48Q96LS8 159 aa8.47□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 CDIP1Q9H305 208 aa8.47□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZTC4 211 aa8.46□□□□□ -1.06
TNS1-220ENST00000611415 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.46□□□□□ -1.06
TNS1-220ENST00000611415 NUPR2A6NF83 97 aa8.45□□□□□ -1.06
TNS1-220ENST00000611415 HCG22E2RYF7 251 aa8.45□□□□□ -1.06
TNS1-220ENST00000611415 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.45□□□□□ -1.06
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TNS1-220ENST00000611415 CXCL6P80162 114 aa8.45□□□□□ -1.06
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TNS1-220ENST00000611415 C22orf24Q9Y442 160 aa8.36□□□□□ -1.07
TNS1-220ENST00000611415 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.35□□□□□ -1.07
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TNS1-220ENST00000611415 Q8N2B8 174 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS1-220ENST00000611415 LIMD2Q9BT23 127 aa8.33□□□□□ -1.08
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TNS1-220ENST00000611415 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.32□□□□□ -1.08
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TNS1-220ENST00000611415 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.28□□□□□ -1.08
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TNS1-220ENST00000611415 Q6ZQT0 140 aa8.27□□□□□ -1.09
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TNS1-220ENST00000611415 LINC00167Q96N53 147 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-220ENST00000611415 FHL3Q13643 280 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-220ENST00000611415 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.26□□□□□ -1.09
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TNS1-220ENST00000611415 IGKV2-30P06310 120 aa8.24□□□□□ -1.09
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TNS1-220ENST00000611415 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.21□□□□□ -1.09
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TNS1-220ENST00000611415 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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TNS1-220ENST00000611415 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.19□□□□□ -1.1
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TNS1-220ENST00000611415 Q8NBF4 154 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.18□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 FSHBP01225 129 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 MDFIQ99750 246 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 SPG11Q96JI7 2443 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 LITAFQ99732 161 aa8.16□□□□□ -1.1
TNS1-220ENST00000611415 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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