RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A096LNI7 61 aa12.15□□□□□ -0.46
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PMVKQ15126 192 aa12.15□□□□□ -0.46
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAGE3Q86Y29 109 aa12.14□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BCP62807 126 aa12.11□□□□□ -0.47
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.11□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.11□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.11□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUPR1O60356 82 aa12.1□□□□□ -0.47
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.09□□□□□ -0.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.09□□□□□ -0.47
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLC3P0DOY3 106 aa12.07□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.07□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REG3GQ6UW15 175 aa12.07□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.07□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.07□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP10-8P60410 259 aa12.06□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.05□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.04□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFA6P56556 154 aa12.04□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZRP5 223 aa12.04□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.04□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.03□□□□□ -0.48
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.03□□□□□ -0.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf25Q5T742 122 aa12.03□□□□□ -0.48
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEPROTL1O95214 131 aa12.01□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ODF1Q14990 250 aa12.01□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf82Q6UX34 121 aa12.01□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf86A6NJI1 115 aa12□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.98□□□□□ -0.49
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.97□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PNN7 141 aa11.96□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPINK8P0C7L1 97 aa11.96□□□□□ -0.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FABP4P15090 132 aa11.95□□□□□ -0.5
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.91□□□□□ -0.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM223A0PJW6 202 aa11.9□□□□□ -0.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.9□□□□□ -0.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.89□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM168BA1KXE4 195 aa11.88□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0QXV9 152 aa11.88□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFTA2Q6UW10 78 aa11.88□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H0Y8G0 127 aa11.87□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2BP63146 152 aa11.87□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.86□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLNP26678 52 aa11.86□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf137Q5JT78 98 aa11.85□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPM2O94777 84 aa11.84□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.84□□□□□ -0.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LPAP08519 4548 aa11.83□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01545Q5VT33 79 aa11.83□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.83□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKCP01834 107 aa11.82□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C3orf79P0CE67 100 aa11.82□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PET117Q6UWS5 81 aa11.82□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.81□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIRC1Q969H9 104 aa11.81□□□□□ -0.52
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