RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 SEC11AP67812 179 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 GAGE2EQ4V326 116 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 LINC01549A6NIU2 74 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 Q8IZM0 81 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 PRSS2P07478 247 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 PMVKQ15126 192 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 PMCHL1Q16048 86 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 LINC00614P0C842 121 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 CKS1BP61024 79 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 HBDP02042 147 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 SPINK8P0C7L1 97 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-226ENST00000551430 F8VRH5 84 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 IGLC3P0DOY3 106 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 COX7B2Q8TF08 81 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 M0QXV9 152 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 NDUFA6P56556 154 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 CXCL5P42830 114 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 RAB5BP61020 215 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 C1orf137Q5JT78 98 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 LINC01600Q96MT4 127 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-226ENST00000551430 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 ATP5LO75964 103 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 H3BRM9 83 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 C11orf86A6NJI1 115 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 BAGE3Q86Y29 109 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 IGLV7-43P04211 117 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 ODF1Q14990 250 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 TRGC2P03986 189 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 REG3GQ6UW15 175 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 C22orf24Q9Y442 160 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-226ENST00000551430 LINC00310P59036 64 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 KRTAP10-8P60410 259 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 UBE2BP63146 152 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 COLCA2A8K830 154 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-226ENST00000551430 HSBP1O75506 76 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 UBR4Q5T4S7 5183 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 H0Y9J4 135 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 SERF1AO75920 110 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 PFN2P35080 140 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 DIRC1Q969H9 104 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 TMEM223A0PJW6 202 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 NUPR1O60356 82 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 ERG28Q9UKR5 140 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 LINC00167Q96N53 147 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-226ENST00000551430 GAGE10A6NGK3 116 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 SCO1O75880 301 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 LRP2P98164 4655 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 Q8NDZ9 215 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 H0Y8G0 127 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 ZNF861PO60384 105 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 LEPROTL1O95214 131 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 VPREB1P12018 145 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 COX17Q14061 63 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 BCE1O60756 84 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 SFTA2Q6UW10 78 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-226ENST00000551430 FABP4P15090 132 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-226ENST00000551430 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-226ENST00000551430 A0A0U1RRA0 63 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-226ENST00000551430 IGKV2D-28P01615 120 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-226ENST00000551430 LINC00158P58513 81 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms