RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 SPINK8P0C7L1 97 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 IGLC3P0DOY3 106 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 GAGE2BQ13066 116 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 FAM229AH3BQW9 127 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PTTG1IPP53801 180 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 Q8IZM0 81 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 STPG4Q8N801 248 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 DPH3Q96FX2 82 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 C11orf86A6NJI1 115 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BKO60814 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BJP06899 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PRSS2P07478 247 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BOP23527 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BBP33778 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BDP58876 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BCP62807 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 RNF151Q2KHN1 245 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 Q6ZRP5 223 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 MYCBP2O75592 4640 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 F8WDY8 70 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 H0Y8G0 127 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 COX7B2Q8TF08 81 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PNN7 141 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 H3BRM9 83 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 LEPROTL1O95214 131 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 FABP4P15090 132 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 CKS1BP61024 79 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 FAM168BA1KXE4 195 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 S100A1P23297 94 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 ODF1Q14990 250 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 GAGE2EQ4V326 116 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 F8VRH5 84 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 CXCL5P42830 114 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-211ENST00000548041 TMEM223A0PJW6 202 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 C7orf33Q8WU49 177 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 M0QXV9 152 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 DPM2O94777 84 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 IGKCP01834 107 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 PFN2P35080 140 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 PLNP26678 52 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 ERG28Q9UKR5 140 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-211ENST00000548041 TNXBP22105 4242 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 A0A0U1RRA0 63 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 C3orf79P0CE67 100 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 LEPROTO15243 131 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 HERC1Q15751 4861 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 KRTDAPP60985 99 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 UBE2BP63146 152 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 LINC01545Q5VT33 79 aa5.31□□□□□ -1.56
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