RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 C5orf38Q86SI9 138 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 XCL1P47992 114 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 DEFB135Q30KP9 77 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 CFAP161Q6P656 301 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-205ENST00000546891 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 DNAL4O96015 105 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 CCL18P55774 89 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 CKS1BP61024 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 Q8NAQ8 132 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 ACANP16112 2415 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 NDUFC2O95298 119 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 GAGE2BQ13066 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 GAGE2EQ4V326 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 LELP1Q5T871 98 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 HIVEP2P31629 2446 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 A0A1B0GX51 115 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 IGKV2D-28P01615 120 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 MALP21145 153 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 PFN2P35080 140 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 REG3AQ06141 175 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 DNHD1Q96M86 4753 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 A0A096LPF7 62 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 H3BNG1 76 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 NF1P21359 2839 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 CUBNO60494 3623 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-205ENST00000546891 TTC32Q5I0X7 151 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 IMUPQ9GZP8 106 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 TMEM126AQ9H061 195 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 LINC00643Q86TS7 51 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 PRR34Q9NV39 138 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 CELA1Q9UNI1 258 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 MTORP42345 2549 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 DEFB4AO15263 64 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 SPAG11BQ08648 103 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 A0A0J9YWU9 116 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 HTN3P15516 51 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.68□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 A0A087WYN8 130 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 H3BQ85 93 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 LINC00167Q96N53 147 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 LECT2O14960 151 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 Q9HAA7 133 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 F8WDY8 70 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 KLK12Q9UKR0 248 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 C22orf24Q9Y442 160 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-205ENST00000546891 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.65□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 GHRHP01286 108 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 ENHOQ6UWT2 76 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 Q8N3U1 123 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 Q8N814 137 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 JMJD1CQ15652 2540 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 MDFIQ99750 246 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 NCR3O14931 201 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 Q6JHZ5 121 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-205ENST00000546891 C2orf48Q96LS8 159 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms