RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEFA3P59666 94 aa3.22□□□□□ -1.89
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 SSPOA2VEC9 5147 aa3.22□□□□□ -1.89
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 AP1S3Q96PC3 154 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MED28Q9H204 178 aa3.19□□□□□ -1.9
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP12-4P60329 112 aa3.13□□□□□ -1.91
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.13□□□□□ -1.91
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A5P33763 92 aa3.12□□□□□ -1.91
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ALG5Q9Y673 324 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 G3V3Q6 166 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BCE1O60756 84 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKR1C3P42330 323 aa3.11□□□□□ -1.91
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