RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf137Q5JT78 98 aa10.33□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.32□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.32□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.32□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa10.32□□□□□ -0.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.29□□□□□ -0.76
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.29□□□□□ -0.76
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CST9LQ9H4G1 147 aa10.27□□□□□ -0.77
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 C22orf24Q9Y442 160 aa10.21□□□□□ -0.77
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.2□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BRM9 83 aa10.19□□□□□ -0.78
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 APOC3P02656 99 aa10.19□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.19□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A096LNJ9 63 aa10.18□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPINK8P0C7L1 97 aa10.18□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFA5Q16718 116 aa10.18□□□□□ -0.78
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRP2P98164 4655 aa10.12□□□□□ -0.79
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.11□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMCHL1Q16048 86 aa10.11□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00167Q96N53 147 aa10.11□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAGE3Q86Y29 109 aa10.1□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YPEL4Q96NS1 127 aa10.1□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCE1O60756 84 aa10.09□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COX17Q14061 63 aa10.09□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFTA2Q6UW10 78 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PFN2P35080 140 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf86A6NJI1 115 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERG28Q9UKR5 140 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAGE10A6NGK3 116 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF213Q63HN8 5207 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM223A0PJW6 202 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSBP1O75506 76 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV2D-28P01615 120 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2AP49459 152 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCO1O75880 301 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRYGAP11844 174 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00158P58513 81 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.96□□□□□ -0.82
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