RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	ATR	Q13535	2644 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WYN8	130 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	AKAP13	Q12802	2813 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WVE0	104 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	MP68	P56378	58 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.71	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.71	□□□□□ -1.49
NEK1-208	ENST00000512193	COX7C	P15954	63 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		Q6Q795	121 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB1	O75438	58 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N2B8	174 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	MAST4	O15021	2626 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	COX17	Q14061	63 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		M0R378	163 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		H0Y9J4	135 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N814	137 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	RETN	Q9HD89	108 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF292	O60281	2723 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		A8MTW9	85 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		Q6JHZ5	121 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	LAMA1	P25391	3075 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	ITPR3	Q14573	2671 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GUV1	79 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YWU9	116 aa		5.66	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	FRY	Q5TBA9	3013 aa		5.65	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.65	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZTC4	211 aa		5.65	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		5.65	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		5.65	□□□□□ -1.5
NEK1-208	ENST00000512193	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.65	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFC2	O95298	119 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	VCAN	P13611	3396 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193		M0QXV9	152 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	CHD6	Q8TD26	2715 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.64	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	PRR4	Q16378	134 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.62	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.62	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.62	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	FHL3	Q13643	280 aa		5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N3U1	123 aa		5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	LITAF	Q99732	161 aa		5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193		M0R2N4	97 aa		5.6	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.59	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.59	□□□□□ -1.51
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZRU5	148 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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