RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP9Q99996 3911 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRANK1O15050 2925 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HYDINQ4G0P3 5121 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF7P21781 194 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNCAP37840 140 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CATR1Q13166 79 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAMP8Q9BV40 100 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RYR3Q15413 4870 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP13Q12802 2813 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.01□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP152O94986 1710 aa-1.01□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.01□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.01□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUBNO60494 3623 aa-1.01□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GU69 56 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAP1L6A6NFF2 107 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTAF1O14981 1849 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLIT1O75093 1534 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG11P61952 73 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSME4Q14997 1843 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf54Q8WWF1 131 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.02□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACACAQ13085 2346 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIP1P30622 1438 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BQF6 201 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1AP04731 61 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRO1854Q9UHT4 67 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMA1P25391 3075 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MUC17Q685J3 4493 aa-1.03□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKD1P98161 4303 aa-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TET3O43151 1660 aa-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.04□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RYR1P21817 5038 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZZEF1O43149 2961 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTDAPP60985 99 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYH7P12883 1935 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.05□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTORP42345 2549 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REV3LO60673 3130 aa-1.06□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JND7 137 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q0VG73 95 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRC2Q9UBG0 1479 aa-1.07□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BNG1 76 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNGT1P63211 74 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NMSQ5H8A3 153 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CGREF1Q99674 301 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A2ML1A8K2U0 1454 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRL2O95490 1459 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL4A6Q14031 1691 aa-1.08□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.09□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.09□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCN9Q8WX39 176 aa-1.09□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.09□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.09□□□□□ -2.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BQ15 152 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG7O60262 68 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SVBPQ8N300 66 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSC22D3Q99576 134 aa-1.1□□□□□ -2.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms