RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		10.96	□□□□□ -0.65
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF151	Q2KHN1	245 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRU5	148 aa		10.94	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8IZM0	81 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.93	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP4	P15090	132 aa		10.92	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL5	P42830	114 aa		10.91	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.91	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0087	Q14695	138 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.9	□□□□□ -0.66
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424		F8VRH5	84 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424		H0Y8G0	127 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	NUPR1	O60356	82 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00310	P59036	64 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7B2	Q8TF08	81 aa		10.89	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE2B	Q13066	116 aa		10.88	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	STPG4	Q8N801	248 aa		10.87	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A096LNI7	61 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf86	A6NJI1	115 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf82	Q6UX34	121 aa		10.86	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PLN	P26678	52 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf25	Q5T742	122 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		10.85	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.84	□□□□□ -0.67
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF1	Q14990	250 aa		10.83	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		10.82	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	DPM2	O94777	84 aa		10.81	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A6	P06703	90 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	HERVK_113	P61574	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE2E	Q4V326	116 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		10.8	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM223	A0PJW6	202 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKC	P01834	107 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRP5	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1HL1	P0DM35	61 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A2	P29034	98 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf202	A1L168	122 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1D1	P51857	326 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	COX17	Q14061	63 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		10.75	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00587	B1AMM8	73 aa		10.74	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTDAP	P60985	99 aa		10.74	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.74	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.74	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LEPROT	O15243	131 aa		10.72	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	HERV-K104	P63124	156 aa		10.72	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.72	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PNN7	141 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PFN2	P35080	140 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	REG3G	Q6UW15	175 aa		10.71	□□□□□ -0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		10.69	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.69	□□□□□ -0.7

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