RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCKP06307 115 aa11.94□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf84H3BNL1 204 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LELP1Q5T871 98 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV1-51P01701 117 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.93□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.92□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RETNQ9HD89 108 aa11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRI3O95415 125 aa11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIOO75962 3097 aa11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV4-1P06312 121 aa11.91□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.9□□□□□ -0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP13Q12802 2813 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERP2Q8N6R1 65 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L23D6RBM5 183 aa11.88□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IMUPQ9GZP8 106 aa11.88□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B9D2Q9BPU9 175 aa11.88□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAQ8IWI9 3026 aa11.87□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.87□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0R2N4 97 aa11.87□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0J9YWU9 116 aa11.87□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8IZM0 81 aa11.86□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf177Q52M58 125 aa11.85□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFC1O43677 76 aa11.85□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMELXQ99217 191 aa11.85□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FHL2Q14192 279 aa11.85□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.84□□□□□ -0.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.83□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC179H3BU77 68 aa11.82□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX7CP15954 63 aa11.82□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0R378 163 aa11.82□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZTC4 211 aa11.81□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.81□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASC2Q6XLA1 102 aa11.81□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.8□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.8□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q9UF83 564 aa11.8□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF292O60281 2723 aa11.79□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7ERS5 55 aa11.79□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.78□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNURFQ9Y675 71 aa11.78□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.77□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf195Q5TG92 126 aa11.77□□□□□ -0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf223Q8N319 242 aa11.77□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH23Q9H251 3354 aa11.77□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WYN8 130 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A6NED7 52 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00315P59091 139 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX17Q14061 63 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.76□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL17DQ8TAD2 202 aa11.75□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WVE0 104 aa11.75□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MTW9 85 aa11.75□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.74□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITPR3Q14573 2671 aa11.74□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR4Q16378 134 aa11.74□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.73□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR15LQ9BU68 103 aa11.72□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.72□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.72□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.72□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0QXV9 152 aa11.71□□□□□ -0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N814 137 aa11.71□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6Q795 121 aa11.7□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf95Q9H693 158 aa11.7□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.7□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.69□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.69□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.68□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELA1Q9UNI1 258 aa11.68□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6JHZ5 121 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N9L7 120 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHD6Q8TD26 2715 aa11.66□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N2B8 174 aa11.65□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GUV1 79 aa11.65□□□□□ -0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.64□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6G6CO95867 125 aa11.64□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.63□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.62□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC7Q8TAX7 377 aa11.62□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms