RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM262E9PQX1 116 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 CELA1Q9UNI1 258 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 CXCL5P42830 114 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 FBN3Q75N90 2809 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 TRACP01848 142 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 LELP1Q5T871 98 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 C5orf38Q86SI9 138 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf82Q6UX34 121 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC2BQ92478 149 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0U1RRA0 63 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 H3BNG1 76 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-28P01615 120 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 CRPP02741 224 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 COX17Q14061 63 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2WQ96B02 151 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 XCL1P47992 114 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 CCL18P55774 89 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00158P58513 81 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 MUC7Q8TAX7 377 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB4AO15263 64 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 REG3AQ06141 175 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 KIAA0087Q14695 138 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 PRR34Q9NV39 138 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 A0A096LPF7 62 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFC2O95298 119 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-212ENST00000477970 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 H0YGX0 51 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 CKS1BP61024 79 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 XGP55808 180 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-11P60412 298 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 PFN2P35080 140 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 MALP21145 153 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0J9YWU9 116 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 MT-ATP8P03928 68 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N3U1 123 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 ACYP1P07311 99 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 VWFP04275 2813 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GX51 115 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-212ENST00000477970 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 ENHOQ6UWT2 76 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 C22orf24Q9Y442 160 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 HTN3P15516 51 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 Q6Q795 121 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00167Q96N53 147 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 SPAG11BQ08648 103 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM126AQ9H061 195 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 KLK12Q9UKR0 248 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WYN8 130 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 DNAL4O96015 105 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 RETNQ9HD89 108 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 SNCGO76070 127 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 F8WDY8 70 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZTC4 211 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GV72 72 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C10orf25Q5T742 122 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-212ENST00000477970 Q9HAA7 133 aa8.19□□□□□ -1.1
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