RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 CBX1P83916 185 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC152Q4G0S7 254 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MCFD2Q8NI22 146 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PYDC1Q8WXC3 89 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RSG1Q9BU20 258 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GHRLQ9UBU3 117 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-3.16□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 hADV38S2A0JD32 116 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 IQCF6A8MYZ5 107 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GABARAPO95166 117 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FABP1P07148 127 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 H1F0P07305 194 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM13P0DJ93 91 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RAP2AP10114 183 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CD9P21926 228 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DTYMKP23919 212 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf52Q96A22 123 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CLUAP1Q96AJ1 413 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SPDL1Q96EA4 605 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PKIBQ9C010 78 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GINM1Q9NU53 330 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RAP2CQ9Y3L5 183 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-3.17□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FAM74A7A6NL05 159 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 J3QLW9 94 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 AIM2O14862 343 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MT-ATP6P00846 226 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 TRGC2P03986 189 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CALB1P05937 261 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CARD18P57730 90 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PSME3P61289 254 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FABP5Q01469 135 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HSPB3Q12988 150 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SMCO1Q147U7 214 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFA5Q16718 116 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 BOLA3Q53S33 107 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SPANXN4Q5MJ08 99 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FRA10AC1Q70Z53 315 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PRNTQ86SH4 94 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RAB24Q969Q5 203 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CXorf40BQ96DE9 158 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 COPS4Q9BT78 406 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HPCAL4Q9UM19 191 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CARD8Q9Y2G2 431 aa-3.18□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 APOC3P02656 99 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 IVLP07476 585 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GABARAPL2P60520 117 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CCL20P78556 96 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SETQ01105 290 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SFTA2Q6UW10 78 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 BORCS8Q96FH0 119 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RGS18Q9NS28 235 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 COX16Q9P0S2 106 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DKKL1Q9UK85 242 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PRNDQ9UKY0 176 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 R4GMQ9 66 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-3.19□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 EFCAB8A8MWE9 144 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 H3BQF6 201 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1G1O75348 118 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 NPYP01303 97 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 OCM2P0CE71 109 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 IGLC2P0DOY2 106 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 IGLC3P0DOY3 106 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MYL2P10916 166 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SDC4P31431 198 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DSTNP60981 165 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35B4Q969S0 331 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MIEN1Q9BRT3 115 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 V9GYH0 126 aa-3.2□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DPPA5A6NC42 116 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 G3V2T6 193 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 APOC1P02654 83 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HSMCR30P0CW71 290 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FXYD2P54710 66 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GNGT1P63211 74 aa-3.21□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms