RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.77□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0J9YXV3 536 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 CKS2P33552 79 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP10-5P60370 271 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG11BQ08648 103 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZRU5 148 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf38Q86SI9 138 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7orf33Q8WU49 177 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.76□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GXF2 115 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM168BA1KXE4 195 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8W036 122 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX7A2LO14548 114 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R2P9O14990 202 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRELID3AQ96N28 172 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.75□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GW15 77 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 S100A8P05109 93 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYCNQ0VAF6 134 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORMDL3Q8N138 153 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOMO95445 188 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R17O96001 155 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT1HL1P0DM35 61 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCYAP1P18509 176 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB5AP20339 215 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB14P61106 215 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf78Q9BR46 151 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP2P98164 4655 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00862A6NCI5 91 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFA1O15239 70 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXTP01178 125 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf82Q6UX34 121 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM104AQ969W3 186 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM141Q96I45 108 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 IMMP2LQ96T52 175 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOMM7Q9P0U1 55 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.72□□□□□ -1.97
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PNN7 141 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPBPP02775 128 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ND4LP03901 98 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ND6P03923 174 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZN92 141 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 COMMD7Q86VX2 200 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 E9PLD3 99 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QXV9 152 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2D1P51668 147 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2BP63146 152 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf137Q5JT78 98 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLLU1Q5K131 121 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8N8P6 123 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF213Q63HN8 5207 aa2.7□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFITM2Q01629 132 aa2.69□□□□□ -1.98
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms