RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 C7orf33Q8WU49 177 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE2EQ4V326 116 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 Q8IZM0 81 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 TNXBP22105 4242 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01549A6NIU2 74 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 HBDP02042 147 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 SEC11AP67812 179 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 J3QL48 77 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS2P07478 247 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 SPINK8P0C7L1 97 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 IGLC3P0DOY3 106 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 TRGC2P03986 189 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA6P56556 154 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00310P59036 64 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 COLCA2A8K830 154 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 OXTP01178 125 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 RAB5BP61020 215 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 CKS1BP61024 79 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 COX7B2Q8TF08 81 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 MT1HL1P0DM35 61 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf86A6NJI1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 F8VRH5 84 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 NUPR1O60356 82 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 SCO1O75880 301 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5LO75964 103 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 BAGE3Q86Y29 109 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 H3BRM9 83 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 CXCL5P42830 114 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-210ENST00000428861 M0QXV9 152 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 SERF1AO75920 110 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf137Q5JT78 98 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 HSBP1O75506 76 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 C22orf24Q9Y442 160 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 ODF1Q14990 250 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM223A0PJW6 202 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV7-43P04211 117 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01600Q96MT4 127 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 PFN2P35080 140 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 H0Y8G0 127 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 LEPROTL1O95214 131 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2BP63146 152 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4B-210ENST00000428861 FABP4P15090 132 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-8P60410 259 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 Q8NDZ9 215 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 ERG28Q9UKR5 140 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BKO60814 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BJP06899 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BOP23527 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BBP33778 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BDP58876 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BCP62807 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00167Q96N53 147 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE10A6NGK3 116 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 REG3GQ6UW15 175 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.49□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0U1RRA0 63 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 H0Y9J4 135 aa6.48□□□□□ -1.37
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