RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 X6R8D5 127 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTDSS1-201ENST00000337004 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.89□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP5G1P05496 136 aa14.87□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A096LPF7 62 aa14.87□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 LECT2O14960 151 aa14.87□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa14.85□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 LYRM9A8MSI8 78 aa14.84□□□□□ -0.03
PTDSS1-201ENST00000337004 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.84□□□□□ -0.03
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PTDSS1-201ENST00000337004 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFC2O95298 119 aa14.77□□□□□ -0.04
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PTDSS1-201ENST00000337004 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.74□□□□□ -0.05
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PTDSS1-201ENST00000337004 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.74□□□□□ -0.05
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PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa14.68□□□□□ -0.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 Q6JHZ5 121 aa14.67□□□□□ -0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.67□□□□□ -0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 UQCRQO14949 82 aa14.66□□□□□ -0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 CCKP06307 115 aa14.65□□□□□ -0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 MIFP14174 115 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTDSS1-201ENST00000337004 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.63□□□□□ -0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 LELP1Q5T871 98 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPAG11BQ08648 103 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTDSS1-201ENST00000337004 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTDSS1-201ENST00000337004 C3orf56Q8N813 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 Q8NDZ9 215 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTDSS1-201ENST00000337004 C10orf25Q5T742 122 aa14.59□□□□□ -0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 C6orf223Q8N319 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0J9YWU9 116 aa14.58□□□□□ -0.08
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PTDSS1-201ENST00000337004 LINC00575Q6W349 94 aa14.57□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PRR34Q9NV39 138 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 KLK12Q9UKR0 248 aa14.56□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 C2orf48Q96LS8 159 aa14.54□□□□□ -0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ITPR2Q14571 2701 aa14.54□□□□□ -0.08
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PTDSS1-201ENST00000337004 INAFM1C9JVW0 142 aa14.53□□□□□ -0.08
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