RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 MUC7Q8TAX7 377 aa11.02□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.01□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0B4J2C4 111 aa11.01□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.01□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMM17BO60830 172 aa11.01□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-33P01772 117 aa11□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 MIAQ16674 131 aa11□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM222AQ5U5X8 452 aa11□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.99□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.99□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 TCL1BO95988 128 aa10.99□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 F5H768 121 aa10.98□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.98□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf47Q569G3 176 aa10.98□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.98□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAH7Q8WXX0 4024 aa10.98□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 GYPEP15421 78 aa10.97□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 Q9H8V8 135 aa10.97□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.97□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZTC4 211 aa10.97□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.96□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 LYRM9A8MSI8 78 aa10.96□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 H7C2G1 150 aa10.96□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 PRO0255Q9UI72 69 aa10.96□□□□□ -0.65
TSNARE1-201ENST00000307180 NPC2P61916 151 aa10.96□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.95□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf84H3BNL1 204 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 DAD1P61803 113 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 CASC10Q5T4H9 136 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A20O43772 301 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 DAND5Q8N907 189 aa10.94□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.93□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 HTN3P15516 51 aa10.93□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 Q1RN00 199 aa10.93□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 PAX4O43316 350 aa10.92□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.91□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 STARD9Q9P2P6 4700 aa10.9□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.9□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.9□□□□□ -0.66
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.9□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.9□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0U1RRA0 63 aa10.9□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.9□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 NUPR2A6NF83 97 aa10.89□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 COX7B2Q8TF08 81 aa10.89□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A096LPF7 62 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GUV1 79 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 COPS9Q8WXC6 57 aa10.88□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIAP1O43715 76 aa10.87□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.87□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A087WZ39 114 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GX51 115 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TENM2Q9NT68 2774 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 C9JAW5 83 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP5G1P05496 136 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.86□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 ATXN8Q156A1 80 aa10.85□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf38Q86SI9 138 aa10.85□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 IMUPQ9GZP8 106 aa10.85□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 SS18Q15532 418 aa10.84□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 COX6CP09669 75 aa10.84□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.82□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01620Q4KN68 170 aa10.82□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 XCL1P47992 114 aa10.81□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 J3KT08 172 aa10.8□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.8□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2WQ96B02 151 aa10.8□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.79□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.79□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 APLNQ9ULZ1 77 aa10.79□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00158P58513 81 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCRQO14949 82 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.78□□□□□ -0.68
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.77□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BT86 120 aa10.77□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.77□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC2BQ92478 149 aa10.77□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 LST1O00453 97 aa10.75□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 Q8N3U1 123 aa10.75□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 ACYP1P07311 99 aa10.74□□□□□ -0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms