RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636257.1

SPTAN1-230, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-230ENST00000636257 TEX261Q6UWH6 196 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 LCE2BO14633 110 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 UPK1BO75841 260 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 C2orf82Q6UX34 121 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 LINC00167Q96N53 147 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 ZNF727A8MUV8 499 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 Q6ZUT4 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 Q8NBF4 154 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 CCDC32Q9BV29 185 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 CNFNQ9BYD5 112 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 TWIST1Q15672 202 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 Q8N377 158 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 XKRY2A2RUG3 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 LINC00846Q9NV44 126 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 PRLHP81277 87 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 ST20Q9HBF5 79 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 RAB19A4D1S5 217 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 IFNA1P01562 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-230ENST00000636257 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 GAGE10A6NGK3 116 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 PAGE4O60829 102 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 TMUB2Q71RG4 321 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.62□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 SLC25A20O43772 301 aa6.62□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.62□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 FCER1GP30273 86 aa6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 FAM104AQ969W3 186 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 PFDN1O60925 122 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 SPRR4Q96PI1 79 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTAN1-230ENST00000636257 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.58□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 IGKV2D-28P01615 120 aa6.58□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 CENPWQ5EE01 88 aa6.58□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.58□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 VCYO14598 125 aa6.57□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 TMEM18Q96B42 140 aa6.57□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 IFITM10A6NMD0 228 aa6.56□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 CKS1BP61024 79 aa6.56□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 TMEM126AQ9H061 195 aa6.56□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 HBBP68871 147 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 SMIM12Q96EX1 92 aa6.55□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 MT2AP02795 61 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 PRSS2P07478 247 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.54□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.53□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 C9orf92A6NGG3 77 aa6.53□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 TMEM238C9JI98 176 aa6.53□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 C11orf52Q96A22 123 aa6.53□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SPTAN1-230ENST00000636257 SSNA1O43805 119 aa6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 NUDT11Q96G61 164 aa6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.52□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 SCO1O75880 301 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 Q8IZM0 81 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 F8VRH5 84 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 M0R378 163 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 GNG4P50150 75 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 BIN3Q9NQY0 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 MT1FP04733 61 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 CCL20P78556 96 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 Q6Q795 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 ENKURQ8TC29 256 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 A0A1B0GV50 99 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-230ENST00000636257 RAB4AP20338 218 aa6.48□□□□□ -1.37
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