RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TRIAP1O43715 76 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 CRIP1P50238 77 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf137Q5JT78 98 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TSHBP01222 138 aa6.34□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.34□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 C6orf223Q8N319 242 aa6.34□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PRYO14603 147 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 P0C879 139 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 CDSNQ15517 529 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 ESRGQ1W209 222 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 C10orf142B7Z368 130 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.33□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF185Q96GF1 192 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 AVPP01185 164 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 REG3GQ6UW15 175 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV1-40P01703 118 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR9Q5T870 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZTC4 211 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 MED12LQ86YW9 2145 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 EDN2P20800 178 aa6.32□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PSPHP1O15172 72 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 MBD6Q96DN6 1003 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 COX17Q14061 63 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 C4orf26Q17RF5 130 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6Q795 121 aa6.31□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 LST1O00453 97 aa6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N6K4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZPA2 131 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 SORL1Q92673 2214 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8IZM0 81 aa6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINK1P00995 79 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPN13Q12923 2485 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 KLLNB2CW77 178 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 EP400Q96L91 3159 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 ALPK3Q96L96 1907 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.28□□□□□ -1.4
CYFIP1-208ENST00000617928 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CELA1Q9UNI1 258 aa6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1AO00555 2505 aa6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.27□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 NRACQ8N912 160 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 NOTCH2Q04721 2471 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 COX6A2Q02221 97 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 ATRXP46100 2492 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV1-51P01701 117 aa6.26□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 Q9BRP9 147 aa6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.25□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf48Q96LS8 159 aa6.24□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.24□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.24□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 C16orf95Q9H693 158 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 YPEL4Q96NS1 127 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 GAS8-AS1O95177 125 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 FHL2Q14192 279 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00208Q96KT6 92 aa6.23□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 ACACBO00763 2458 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms