RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.91□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 TRACP01848 142 aa10.91□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 NPC2P61916 151 aa10.91□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 H7C423 109 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 COX7CP15954 63 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 I3L3M4 83 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.9□□□□□ -0.66
CTIF-205ENST00000587860 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
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CTIF-205ENST00000587860 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.87□□□□□ -0.67
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CTIF-205ENST00000587860 CRYGAP11844 174 aa10.84□□□□□ -0.67
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CTIF-205ENST00000587860 RHOHQ15669 191 aa10.83□□□□□ -0.68
CTIF-205ENST00000587860 DAND5Q8N907 189 aa10.83□□□□□ -0.68
CTIF-205ENST00000587860 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.83□□□□□ -0.68
CTIF-205ENST00000587860 INSP01308 110 aa10.83□□□□□ -0.68
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.81□□□□□ -0.68
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CTIF-205ENST00000587860 LEPROTO15243 131 aa10.74□□□□□ -0.69
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CTIF-205ENST00000587860 A0A0J9YXY3 114 aa10.74□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 ATOX1O00244 68 aa10.74□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 A8MTW9 85 aa10.73□□□□□ -0.69
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CTIF-205ENST00000587860 H3BS24 57 aa10.72□□□□□ -0.69
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CTIF-205ENST00000587860 DEFB130AP0DP74 79 aa10.72□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.72□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 DEFB4AO15263 64 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-3P60369 221 aa10.71□□□□□ -0.69
CTIF-205ENST00000587860 J3QKU1 62 aa10.71□□□□□ -0.69
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