RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LLGL2-222	ENST00000583658	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.77	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.74	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658		K7EMI3	77 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	IMMP2L	Q96T52	175 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658		Q6ZRP5	223 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658		Q8N8P6	123 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LLGL2-222	ENST00000583658	NPS	P0C0P6	89 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFA1	O15239	70 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.69	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	TNXB	P22105	4242 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A087WZ39	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		11.68	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		11.67	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	G0S2	P27469	103 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658		Q6ZN92	141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A1W2PNN7	141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LLGL2-222	ENST00000583658	UBE2D1	P51668	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	AMELX	Q99217	191 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	VCX2	Q9H322	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658		A0A0J9YXV3	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	KIAA0087	Q14695	138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	SEC11A	P67812	179 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	C10orf25	Q5T742	122 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	SEC11C	Q9BY50	192 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LLGL2-222	ENST00000583658	MT-ND6	P03923	174 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	S100P	P25815	95 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	IFITM2	Q01629	132 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	COX19	Q49B96	90 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	HERVK_113	P63121	156 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		11.56	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		11.55	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	PRSS2	P07478	247 aa		11.55	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658		Q8IZM0	81 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	KRTAP10-8	P60410	259 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	GAGE2E	Q4V326	116 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	C1orf137	Q5JT78	98 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		11.53	□□□□□ -0.56
LLGL2-222	ENST00000583658	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		11.52	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.52	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	CKS1B	P61024	79 aa		11.52	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.52	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM168B	A1KXE4	195 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LLGL2-222	ENST00000583658	ODF1	Q14990	250 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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