RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.39□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 C5orf38Q86SI9 138 aa9.39□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.39□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.39□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 G0S2P27469 103 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 COX6A2Q02221 97 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM141Q96I45 108 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 CARD19Q96LW7 228 aa9.38□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.37□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 MT-ND6P03923 174 aa9.37□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SYCNQ0VAF6 134 aa9.37□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 NDUFA5Q16718 116 aa9.37□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.37□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 APOC3P02656 99 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 NPSP0C0P6 89 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 CHTF8P0CG12 524 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 Q6ZN92 141 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.36□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.35□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.35□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SNAPINO95295 136 aa9.35□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SVBPQ8N300 66 aa9.35□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 C2orf48Q96LS8 159 aa9.35□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 A0A087WYN8 130 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 SPAG11BQ08648 103 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 MAJINQ3KP22 176 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 VCX2Q9H322 139 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.34□□□□□ -0.91
C15orf40-211ENST00000565712 IGIPA6NJ69 53 aa9.33□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.33□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.33□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.33□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 A0A096LNI7 61 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 F8WDY8 70 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 UBE2D1P51668 147 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 Q6ZRU5 148 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 TOMM6Q96B49 74 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 AMELXQ99217 191 aa9.32□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 A0A087WZ39 114 aa9.31□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LINC01546A6NGU7 62 aa9.31□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 TIMM17AQ99595 171 aa9.31□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.3□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LINC01549A6NIU2 74 aa9.3□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.3□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 STPG4Q8N801 248 aa9.3□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.3□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 FA2HQ7L5A8 372 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 ERASQ7Z444 233 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 NDUFA1O15239 70 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 PTTG1IPP53801 180 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 SEC11AP67812 179 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 RNF151Q2KHN1 245 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 C7orf33Q8WU49 177 aa9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
C15orf40-211ENST00000565712 GAGE2BQ13066 116 aa9.27□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 HERVK_113P63121 156 aa9.25□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 A0A0J9YXV3 536 aa9.24□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 KIAA0087Q14695 138 aa9.24□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 MYCBP2O75592 4640 aa9.24□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 PRSS2P07478 247 aa9.23□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 C10orf25Q5T742 122 aa9.23□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.23□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.23□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00614P0C842 121 aa9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 YPEL4Q96NS1 127 aa9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.22□□□□□ -0.93
C15orf40-211ENST00000565712 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.21□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.21□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 RAB5BP61020 215 aa9.21□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 CST9LQ9H4G1 147 aa9.21□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.21□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.2□□□□□ -0.94
C15orf40-211ENST00000565712 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms