RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ZEB1-223	ENST00000561304	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1B0GXF2	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	VCY	O14598	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		D6R8Y8	96 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	NPY	P01303	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	FCER1G	P30273	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	PEA15	Q15121	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SS18	Q15532	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	STPG4	Q8N801	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZRU5	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	TCAP	O15273	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	PPP1R17	O96001	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	CKS2	P33552	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	HBB	P68871	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1B0GW15	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	COX7A2L	O14548	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A0J9YXV3	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PNN7	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		A4D1N5	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304		F8W036	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZEB1-223	ENST00000561304	LRP2	P98164	4655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	S100A8	P05109	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	APOM	O95445	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PPBP	P02775	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	IFITM2	Q01629	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZRP5	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A087WZ39	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFA1	O15239	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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