RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 IFITM10A6NMD0 228 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 SYCNQ0VAF6 134 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 DPH3Q96FX2 82 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 MAJINQ3KP22 176 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 Q6ZRU5 148 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 TMEM141Q96I45 108 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 SPAG11BQ08648 103 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-226ENST00000551430 S100PP25815 95 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 LINC00242Q5T6M2 205 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 C2orf48Q96LS8 159 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 IGIPA6NJ69 53 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 APOMO95445 188 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 RHEBQ15382 184 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 STPG4Q8N801 248 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 K7EMI3 77 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 UBE2D1P51668 147 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 AMELXQ99217 191 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 A0A087WZ39 114 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 A0A0J9YXV3 536 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 PTTG1IPP53801 180 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 C10orf25Q5T742 122 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-226ENST00000551430 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 GAGE2BQ13066 116 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 KIAA0087Q14695 138 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 TOMM6Q96B49 74 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 J3QL48 77 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 NPSP0C0P6 89 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 Q6ZN92 141 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 VCX2Q9H322 139 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 LINC01546A6NGU7 62 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 APOC3P02656 99 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 MT-ND6P03923 174 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 RNF151Q2KHN1 245 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 COX19Q49B96 90 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 C7orf33Q8WU49 177 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 TIMM17AQ99595 171 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 A0A1W2PNN7 141 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 NDUFA1O15239 70 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-226ENST00000551430 F8WDY8 70 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 OXTP01178 125 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 C2orf82Q6UX34 121 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 ERASQ7Z444 233 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 G0S2P27469 103 aa13□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 TNXBP22105 4242 aa13□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 SVBPQ8N300 66 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 SNAPINO95295 136 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 Q6ZRP5 223 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 FA2HQ7L5A8 372 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 HMCN2Q8NDA2 5059 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 YPEL4Q96NS1 127 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 NDUFA5Q16718 116 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-226ENST00000551430 A0A096LNJ9 63 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 HERVK_113P63121 156 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 FAM168BA1KXE4 195 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 CST9LQ9H4G1 147 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 MT1HL1P0DM35 61 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-226ENST00000551430 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms