RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 F8VRH5 84 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CRPP02741 224 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 IGLC3P0DOY3 106 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 XCL1P47992 114 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 FOXI1Q12951 378 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 MIAQ16674 131 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 PET117Q6UWS5 81 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 TTC32Q5I0X7 151 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 NFE4Q86UQ8 179 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 ATOH7Q8N100 152 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 K7EP13 123 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 AKR1D1P51857 326 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 SS18Q15532 418 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 PYY3Q5JQD4 70 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 C5orf38Q86SI9 138 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 DPM2O94777 84 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 WFDC2Q14508 124 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-216ENST00000549221 A0A087WZ39 114 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SCGB1D1O95968 90 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 IGKCP01834 107 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SPINK8P0C7L1 97 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 PLNP26678 52 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 HERVK_113P63121 156 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 MAJINQ3KP22 176 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 C6orf223Q8N319 242 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SVIPQ8NHG7 77 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 hDV102S1A0JD36 115 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 C20orf202A1L168 122 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 COX7A2LO14548 114 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 LECT2O14960 151 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SEC11AP67812 179 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 STPG4Q8N801 248 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 C15orf56Q8N910 161 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 HERC1Q15751 4861 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TMEM223A0PJW6 202 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 RTL8CO15255 209 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 RMI2Q96E14 147 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 USP17L23D6RBM5 183 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 PSCAO43653 123 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 KIAA0087Q14695 138 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TM2D2Q9BX73 214 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 E9PLD3 99 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 H3BRM9 83 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 MALP21145 153 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TNP2Q05952 138 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 SPAG11BQ08648 103 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 COX11Q9Y6N1 276 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-216ENST00000549221 A0A087WTM6 91 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 SLPIP03973 132 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 SMIM6P0DI80 62 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 C2orf82Q6UX34 121 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-216ENST00000549221 LEPROTO15243 131 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms