RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TSHB	P01222	138 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	ESD	P10768	282 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	IMMP2L	Q96T52	175 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MED9	Q9NWA0	146 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM168B	A1KXE4	195 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX46	H3BTG2	121 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	FCER1G	P30273	86 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V3Q6	166 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE6D	O43924	150 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE2E	Q4V326	116 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM210A	Q96ND0	272 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QXV9	152 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA1	O15239	70 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511		F8WDY8	70 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF345	Q14585	488 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZUT4	128 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM18	Q96B42	140 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	VCY	O14598	125 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS2	P07478	247 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MWL6	223 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF861P	O60384	105 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EN84	100 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYGA	P11844	174 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	OCC1	Q8TAD7	63 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUT8	65 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R17	O96001	155 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB4A	P20338	218 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC17	Q685J3	4493 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A0MQY5	61 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	IFITM10	A6NMD0	228 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	HMSD	A8MTL9	139 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	NUPR1	O60356	82 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X002	238 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	HBB	P68871	147 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SKAP2-209	ENST00000497511	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPG	P53567	150 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TCAP	O15273	167 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RIG	Q13278	110 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRXL	Q17RH7	258 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.31	□□□□□ -1.4

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