RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOCK2Q92608 1830 aa-0.87□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL11Q969Q4 196 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.88□□□□□ -2.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.88□□□□□ -2.55
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.89□□□□□ -2.55
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0YGG7 62 aa-0.9□□□□□ -2.55
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.9□□□□□ -2.55
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.94□□□□□ -2.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC11AP67812 179 aa-0.95□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DR1Q01658 176 aa-0.95□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.95□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.95□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOCK1Q14185 1865 aa-0.95□□□□□ -2.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCL22O00626 93 aa-0.96□□□□□ -2.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.96□□□□□ -2.56
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.97□□□□□ -2.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSLPQ969D9 159 aa-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.98□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCHHQ07283 1943 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2D3P61077 147 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2D2P62837 147 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.99□□□□□ -2.57
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf57Q99622 126 aa-0.99□□□□□ -2.57
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