RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 GAGE2EQ4V326 116 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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SDCCAG3-211ENST00000486441 C22orf24Q9Y442 160 aa8.33□□□□□ -1.08
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.29□□□□□ -1.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 D6R8Y8 96 aa8.28□□□□□ -1.08
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SDCCAG3-211ENST00000486441 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.28□□□□□ -1.08
SDCCAG3-211ENST00000486441 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.28□□□□□ -1.08
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.27□□□□□ -1.09
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SDCCAG3-211ENST00000486441 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.26□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GXF2 115 aa8.26□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.26□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.25□□□□□ -1.09
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SDCCAG3-211ENST00000486441 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 AMELXQ99217 191 aa8.24□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GW15 77 aa8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRSS47A8MTI9 375 aa8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM141Q96I45 108 aa8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 LINC00167Q96N53 147 aa8.23□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SDCCAG3-211ENST00000486441 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.21□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q6ZN92 141 aa8.21□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q8IZM0 81 aa8.21□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.2□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPBPP02775 128 aa8.2□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADIRFQ15847 76 aa8.2□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.2□□□□□ -1.1
SDCCAG3-211ENST00000486441 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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