RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PTTG1IPP53801 180 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 RAB14P61106 215 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 PRELID3AQ96N28 172 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 MT-ND6P03923 174 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 ODF1Q14990 250 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 ORMDL3Q8N138 153 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 PPBPP02775 128 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE2EQ4V326 116 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 REG3GQ6UW15 175 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZRP5 223 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PNN7 141 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA1O15239 70 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 MT-ND4LP03901 98 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 MT1HL1P0DM35 61 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf137Q5JT78 98 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf48Q96LS8 159 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.03□□□□□ -1.6
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087WZ39 114 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GXF2 115 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 IMMP2LQ96T52 175 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.02□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 FAM168BA1KXE4 195 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf25Q5T742 122 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZN92 141 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM141Q96I45 108 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.01□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS2P07478 247 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2BP63146 152 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf82Q6UX34 121 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC16Q96DE5 110 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01600Q96MT4 127 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 VCX2Q9H322 139 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 RNF213Q63HN8 5207 aa5□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 CKS1BP61024 79 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 Q8N8P6 123 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 FAM104AQ969W3 186 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 LRP2P98164 4655 aa4.99□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 RNF151Q2KHN1 245 aa4.98□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.98□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.98□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.98□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 XP32Q5T750 250 aa4.97□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.97□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.97□□□□□ -1.61
CTPS1-209ENST00000480420 F8WDY8 70 aa4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 M0QXV9 152 aa4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2D1P51668 147 aa4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV7-43P04211 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 S100PP25815 95 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0087Q14695 138 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 DIRC1Q969H9 104 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.95□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 G0S2P27469 103 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA6P56556 154 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.94□□□□□ -1.62
CTPS1-209ENST00000480420 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.94□□□□□ -1.62
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