RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 V9GYY9 64 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 PTPRBP23467 1997 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 NRACQ8N912 160 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 LECT2O14960 151 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 A0A0J9YWU9 116 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 LINC00694P0DN24 101 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 C20orf197Q8N268 126 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 A0A0J9YXY3 114 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 A0A0U1RQV1 116 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 A0A087WZ39 114 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 PDE6GP18545 87 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 POLQO75417 2590 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 GAS8-AS1O95177 125 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 EDN2P20800 178 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 IMUPQ9GZP8 106 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TRIAP1O43715 76 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 Q6Q795 121 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.96□□□□□ -0.81
NISCH-207ENST00000479054 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 PROK1P58294 105 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 C9orf85Q96MD7 179 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 COX7CP15954 63 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 NREPQ16612 68 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 UPK3BQ9BT76 320 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 MUC7Q8TAX7 377 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 MTORP42345 2549 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 SERP2Q8N6R1 65 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 M0R2N4 97 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 PRM2P04554 102 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 UBE2D1P51668 147 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 TMEM223A0PJW6 202 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-207ENST00000479054 TSHBP01222 138 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 Q8N2B8 174 aa9.88□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.88□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.88□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.88□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 MP68P56378 58 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 USP17L23D6RBM5 183 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 UBE2D3P61077 147 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 UBE2D2P62837 147 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 ENHOQ6UWT2 76 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 C1orf195Q5TG92 126 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 LST1O00453 97 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-207ENST00000479054 M0R378 163 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 RETNQ9HD89 108 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 F8WDY8 70 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 COX17Q14061 63 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 ACANP16112 2415 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 IGIPA6NJ69 53 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 H0Y9J4 135 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-207ENST00000479054 CDIP1Q9H305 208 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms