RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.27□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNAPINO95295 136 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MT-ND6P03923 174 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XCL1P47992 114 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SVBPQ8N300 66 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C15orf56Q8N910 161 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01549A6NIU2 74 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLPIP03973 132 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01620Q4KN68 170 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COX7A2LO14548 114 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APOMO95445 188 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APOC3P02656 99 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MALP21145 153 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q6ZUT4 128 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM104AQ969W3 186 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 F8WDY8 70 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ODF1Q14990 250 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q5VSD8 79 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q6ZN92 141 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCXQ7RTU7 201 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM141Q96I45 108 aa5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFITM10A6NMD0 228 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2orf48Q96LS8 159 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VCX2Q9H322 139 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01546A6NGU7 62 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGIPA6NJ69 53 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HAMPP81172 84 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYCNQ0VAF6 134 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERASQ7Z444 233 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C5orf38Q86SI9 138 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOMM6Q96B49 74 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DPH3Q96FX2 82 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AMELXQ99217 191 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIMM17AQ99595 171 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEC11AP67812 179 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COX6A2Q02221 97 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF151Q2KHN1 245 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A087WZ39 114 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBE2D1P51668 147 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FA2HQ7L5A8 372 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CARD19Q96LW7 228 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.19□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PANO1I0J062 215 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB5BP61020 215 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HERVK_113P63121 156 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAT1Q14517 4588 aa5.18□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A087WYN8 130 aa5.17□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00614P0C842 121 aa5.17□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPAG11BQ08648 103 aa5.17□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q6ZRU5 148 aa5.17□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.17□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDUFA1O15239 70 aa5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms