RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPINO95295 136 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 APOMO95445 188 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MT-ND6P03923 174 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 G0S2P27469 103 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CHTF8P0CG12 524 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SYCNQ0VAF6 134 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-204ENST00000416021 IGIPA6NJ69 53 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 CARD19Q96LW7 228 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 VCX2Q9H322 139 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 NPSP0C0P6 89 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZN92 141 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00242Q5T6M2 205 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 TOMM6Q96B49 74 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 AMELXQ99217 191 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WYN8 130 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2D1P51668 147 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf48Q96LS8 159 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01546A6NGU7 62 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 SPAG11BQ08648 103 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 MAJINQ3KP22 176 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZRU5 148 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WZ39 114 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM17AQ99595 171 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A096LNI7 61 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FA2HQ7L5A8 372 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ERASQ7Z444 233 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01549A6NIU2 74 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 F8WDY8 70 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 STPG4Q8N801 248 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 YPEL4Q96NS1 127 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE2BQ13066 116 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF151Q2KHN1 245 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0J9YXV3 536 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00614P0C842 121 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC11AP67812 179 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0087Q14695 138 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFA1O15239 70 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PTTG1IPP53801 180 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HERVK_113P63121 156 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf25Q5T742 122 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CST9LQ9H4G1 147 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB5BP61020 215 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf33Q8WU49 177 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCBP2O75592 4640 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A096LNJ9 63 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS2P07478 247 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PMVKQ15126 192 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf82Q6UX34 121 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PNN7 141 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PMCHL1Q16048 86 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00469Q8N7U9 141 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HBDP02042 147 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.21□□□□□ -0.29
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