RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDC2P34741 201 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB136Q30KP8 78 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 BORCS8Q96FH0 119 aa-3.72□□□□□ -3
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF27Q86VH2 1401 aa-3.72□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIIAD1A6NNX1 92 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YIV9 168 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMLR1H3BR10 107 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFC2O95298 119 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOA2P02652 100 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf128Q5T292 105 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP35Q8NFH5 326 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARVGQ9HBI0 331 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP7BP35670 1465 aa-3.73□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD2P0DJD1 1756 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SKP1P63208 163 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAIMQ9NVQ4 179 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSENENQ9NZ42 101 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMPXQ9UHP9 88 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPKBP1O60336 1514 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLXNC1O60486 1568 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0QZ92 97 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 CROCCP2Q86T23 111 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGBQ8N7X0 1667 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf79P0CE67 100 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLC1P0CG04 106 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 V9GYQ6 96 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHROOM2Q13796 1616 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAPK1P53355 1430 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD36A6QL64 1941 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBLN1P23435 193 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQP10Q96PS8 301 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 MGST2Q99735 147 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 A8MTW9 85 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPSNAP2O75323 286 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX5BP10606 129 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB1A1P11684 91 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00158P58513 81 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMGT1Q8N4V1 131 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-172P-201ENST00000411000 NWD2Q9ULI1 1742 aa-3.78□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABARAPH6UMI1 98 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 H7C1C5 153 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGN4O00479 90 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBP4P02753 201 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN1P31025 176 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN6P62502 163 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMED4Q7Z7H5 227 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBLN4Q9NTU7 201 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SZT2Q5T011 3432 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLB1Q6P1J6 1458 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMARCA2P51531 1590 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH13Q9UKX3 1938 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0QZK8 103 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRAP04437 139 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB130BP0DP73 79 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB130AP0DP74 79 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC26Q8NHZ8 85 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 USE1Q9NZ43 259 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSTAP01040 98 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TET3O43151 1660 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PREX1Q8TCU6 1659 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF10O15013 1369 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 FABP12A6NFH5 140 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R2P41236 205 aa-3.83□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.6 ms