RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 NUPR1O60356 82 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 AMN1Q8IY45 258 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 A8MWL6 223 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TEX46H3BTG2 121 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf82Q6UX34 121 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 NRACQ8N912 160 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 BORCS7Q96B45 105 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 KIR2DL4Q99706 377 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 C22orf24Q9Y442 160 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM18Q96B42 140 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 HMSDA8MTL9 139 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GUT8 65 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 IFITM10A6NMD0 228 aa11.11□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.11□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.11□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 HIGD1CA8MV81 97 aa11.1□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 BCE1O60756 84 aa11.1□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 CT83Q5H943 113 aa11.1□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R17O96001 155 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 HBBP68871 147 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF727A8MUV8 499 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R2P9O14990 202 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXD12-201ENST00000404162 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RIGQ13278 110 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf78Q9BR46 151 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00167Q96N53 147 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TCAPO15273 167 aa11□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 FAM104BQ5XKR9 115 aa11□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM250H0YL14 139 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CTAG1AP78358 180 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF6BO95407 300 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CEBPGP53567 150 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00862A6NCI5 91 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CKS1BP61024 79 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 OSTCQ9NRP0 149 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GAGE10A6NGK3 116 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS2P07478 247 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CKS2P33552 79 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2AP49459 152 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01551Q86U37 167 aa10.96□□□□□ -0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 V9GYV3 84 aa10.95□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZN92 141 aa10.94□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf22Q8N5N4 141 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa10.93□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 NPYP01303 97 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 RGS21Q2M5E4 152 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 Q8IZM0 81 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM141Q96I45 108 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 LCE2CQ5TA81 110 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 D6R8Y8 96 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXD12-201ENST00000404162 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms