RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPRMP28827 1452 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYH8P13535 1937 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLIP1P30622 1438 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0G2JND7 137 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM218A2RU14 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 S100A1P23297 94 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPRR2BP35325 72 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNG4P50150 75 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HMGN3Q15651 99 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM203Q969S6 136 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM107BQ9H098 131 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 USF3Q68DE3 2245 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.03□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LAMB1P07942 1786 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TGP01266 2768 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRP6O75581 1613 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GU69 56 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNG7O60262 68 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MPC2O95563 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CYB5AP00167 134 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UQCRHP07919 91 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC00032P0C843 101 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UBE2D3P61077 147 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UBE2D2P62837 147 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPP3R1P63098 170 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNG8Q9UK08 70 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SYNJ1O43426 1573 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DNAJC13O75165 2243 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRANK1O15050 2925 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADGRB1O14514 1584 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 I3L2K1 104 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 K7EP13 123 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q0VG73 95 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ABCC2Q92887 1545 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HIVEP1P15822 2718 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DOCK2Q92608 1830 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYH6P13533 1939 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TCHHQ07283 1943 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C20orf202A1L168 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H0Y9P7 68 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PITX3O75364 302 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSLPQ969D9 159 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAPPAQ13219 1627 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.5 ms