RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CDK2AP2O75956 126 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK8P0C7L1 97 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 MED14OSP0DP75 135 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IQCJQ1A5X6 159 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRC-201ENST00000348564 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-201ENST00000348564 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-201ENST00000348564 SERF1AO75920 110 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 NPSP0C0P6 89 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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