RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0J9YY99	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	MIA	Q16674	131 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RBM23-233	ENST00000557667	CARD19	Q96LW7	228 aa		6.09	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		X6R8D5	127 aa		6.09	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	PSMB2	P49721	201 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	JPT2	Q9H910	190 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE12B	A1L429	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	PAX4	O43316	350 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE7	O76087	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB1	P60022	68 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	COX17	Q14061	63 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	SIGMAR1	Q99720	223 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGLL5	B9A064	214 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H3BUT2	72 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	FHL2	Q14192	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	C3orf56	Q8N813	242 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE4	Q13068	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE5	Q13069	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GAGE13	Q4V321	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZTI0	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H7C2G1	150 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	RMI2	Q96E14	147 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H3BMG7	143 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		V9GYY9	64 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-30	P01768	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	LELP1	Q5T871	98 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0J9YXV3	536 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZQT7	251 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	LINC01600	Q96MT4	127 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	RETN	Q9HD89	108 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	CENPE	Q02224	2701 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GX51	115 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H3BS24	57 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	CFC1B	P0CG36	223 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	CFC1	P0CG37	223 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZUT4	128 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		Q8IZM0	81 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	ITPR3	Q14573	2671 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H0YGX0	51 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	GYPE	P15421	78 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667		H3BT86	120 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	FXYD2	P54710	66 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RBM23-233	ENST00000557667	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667		A0A087WZ39	114 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	SCGB1A1	P11684	91 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RBM23-233	ENST00000557667	CRP	P02741	224 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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