RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.15□□□□□ -1.9
CDH18-210ENST00000511273 RAB24Q969Q5 203 aa3.15□□□□□ -1.9
CDH18-210ENST00000511273 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.15□□□□□ -1.9
CDH18-210ENST00000511273 SMIM30A4D0T7 59 aa3.15□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 GAGE2EQ4V326 116 aa3.15□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 VCXQ9H320 206 aa3.15□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.15□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 UBE2G2P60604 165 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 S100A14Q9HCY8 104 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 NTF3P20783 257 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.14□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 LINC00483Q53H64 154 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 MBD2Q9UBB5 411 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SFT2D2O95562 160 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 IGLV6-57P01721 117 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.13□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 A8MWP4 228 aa3.12□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.12□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.12□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 ALG5Q9Y673 324 aa3.12□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 M0R036 132 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 GNAO1P09471 354 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SULT1A1P50225 295 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 STX12Q86Y82 276 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 NCS1P62166 190 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 MZT2AQ6P582 158 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.11□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SH2D1AO60880 128 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 UPK1BO75841 260 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 HYLS1Q96M11 299 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 NUDT15Q9NV35 164 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 ZNF727A8MUV8 499 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 TRGC1P0CF51 173 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 GNGT1P63211 74 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 SGK494Q96LW2 274 aa3.1□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 LINC00167Q96N53 147 aa3.1□□□□□ -1.91
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CDH18-210ENST00000511273 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.09□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.09□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 EPDR1Q9UM22 224 aa3.09□□□□□ -1.91
CDH18-210ENST00000511273 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.09□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.09□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 TEX261Q6UWH6 196 aa3.09□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.09□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 MRAP2Q96G30 205 aa3.09□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.08□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 KRTAP10-5P60370 271 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 GNG5P63218 68 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 PPP1R1AQ13522 171 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 C7orf66A4D0T2 115 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 C9orf92A6NGG3 77 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 C10orf25Q5T742 122 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 Q5XG85 94 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 Q6ZVH6 145 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.07□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 MGPP08493 103 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 Q75L30 129 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 NRACQ8N912 160 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 FMC1Q96HJ9 113 aa3.06□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 BCAP31P51572 246 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 KIAA0087Q14695 138 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 A0A1W2PRE2 83 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 I3L3M4 83 aa3.05□□□□□ -1.92
CDH18-210ENST00000511273 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.05□□□□□ -1.92
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