RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MIA	Q16674	131 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.41	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.4	□□□□□ -0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF6	P10767	208 aa		11.39	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ESD	P10768	282 aa		11.39	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	C14orf177	Q52M58	125 aa		11.39	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM229A	H3BQW9	127 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	REG3A	Q06141	175 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZSA8	131 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FAT1	Q14517	4588 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS47	A8MTI9	375 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	G0S2	P27469	103 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC2	Q14508	124 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EMI3	77 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		Q5VSD8	79 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N8P6	123 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	HAMP	P81172	84 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SS18	Q15532	418 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LECT2	O14960	151 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL25	O15444	150 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L23	D6RBM5	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB5B	P61020	215 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZN92	141 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NPS	P0C0P6	89 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	XCL1	P47992	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZUT4	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS1	P07477	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	VCX2	Q9H322	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00614	P0C842	121 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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