RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.62□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 K7EN84 100 aa8.62□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.62□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 BCL2L11O43521 198 aa8.61□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP6V1G1O75348 118 aa8.61□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.61□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 OCC1Q8TAD7 63 aa8.6□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.6□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 MT-ND6P03923 174 aa8.59□□□□□ -1.03
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGLV7-43P04211 117 aa8.59□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 BTF3L4Q96K17 158 aa8.59□□□□□ -1.03
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SDCCAG3-211ENST00000486441 APOMO95445 188 aa8.58□□□□□ -1.04
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SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM101Q96IK0 257 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 BIN3Q9NQY0 253 aa8.58□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GVG6 124 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 C2orf48Q96LS8 159 aa8.57□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.56□□□□□ -1.04
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SDCCAG3-211ENST00000486441 H0Y9J4 135 aa8.56□□□□□ -1.04
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SDCCAG3-211ENST00000486441 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 ISOC2Q96AB3 205 aa8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.56□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM168BA1KXE4 195 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 COX7A2LO14548 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 DIRC1Q969H9 104 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM104AQ969W3 186 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRAP2Q96G30 205 aa8.55□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNF151Q2KHN1 245 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 C5orf38Q86SI9 138 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 ST20Q9HBF5 79 aa8.54□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SDCCAG3-211ENST00000486441 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.52□□□□□ -1.05
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SDCCAG3-211ENST00000486441 C10orf25Q5T742 122 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.52□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A087WZ39 114 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.51□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRR4Q16378 134 aa8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMKR1H3BMG3 65 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPAG11BQ08648 103 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 RGS21Q2M5E4 152 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q6ZUT4 128 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 NRACQ8N912 160 aa8.49□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 A8MWL6 223 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 TEX46H3BTG2 121 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 VCYO14598 125 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 AMN1Q8IY45 258 aa8.48□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 S100A1P23297 94 aa8.47□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 CT83Q5H943 113 aa8.47□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.47□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.47□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.47□□□□□ -1.05
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GUT8 65 aa8.46□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.46□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA0087Q14695 138 aa8.45□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 NDUFA5Q16718 116 aa8.45□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 IMMP2LQ96T52 175 aa8.45□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 HIGD1CA8MV81 97 aa8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 F8WDY8 70 aa8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 TSKUQ8WUA8 353 aa8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.44□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM250H0YL14 139 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 FCER1GP30273 86 aa8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.43□□□□□ -1.06
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