RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 FAT1Q14517 4588 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZSA8 131 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 C20orf78Q9BR46 151 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 PRSS1P07477 247 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 CKS2P33552 79 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-209ENST00000485765 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
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NISCH-209ENST00000485765 D6R8Y8 96 aa12.37□□□□□ -0.43
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NISCH-209ENST00000485765 COX19Q49B96 90 aa12.37□□□□□ -0.43
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NISCH-209ENST00000485765 TMEM101Q96IK0 257 aa12.37□□□□□ -0.43
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NISCH-209ENST00000485765 HAMPP81172 84 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-209ENST00000485765 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-209ENST00000485765 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-209ENST00000485765 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.33□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.33□□□□□ -0.44
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NISCH-209ENST00000485765 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.32□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 PRSS47A8MTI9 375 aa12.32□□□□□ -0.44
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NISCH-209ENST00000485765 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.31□□□□□ -0.44
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NISCH-209ENST00000485765 C15orf56Q8N910 161 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 TMEM18Q96B42 140 aa12.3□□□□□ -0.44
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NISCH-209ENST00000485765 hDV102S1A0JD36 115 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 SLPIP03973 132 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 Q5VSD8 79 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-209ENST00000485765 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.29□□□□□ -0.44
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NISCH-209ENST00000485765 SCXQ7RTU7 201 aa12.26□□□□□ -0.45
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NISCH-209ENST00000485765 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.24□□□□□ -0.45
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NISCH-209ENST00000485765 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.22□□□□□ -0.45
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NISCH-209ENST00000485765 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.2□□□□□ -0.46
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NISCH-209ENST00000485765 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 PANO1I0J062 215 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 K7EMI3 77 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 COX7A2LO14548 114 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.16□□□□□ -0.46
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