RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC179H3BU77 68 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV2-11P01706 119 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 AMELXQ99217 191 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 CTSZQ9UBR2 303 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 KLK9Q2XQG4 91 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N6K4 173 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 LELP1Q5T871 98 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 IGIPA6NJ69 53 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 TECTAO75443 2155 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 G3V318 75 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N9L7 120 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 DEFB130AP0DP74 79 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 E7EUB6 86 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 Q6YL49 198 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRD-201ENST00000355233 LY6G6DO95868 133 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-201ENST00000355233 CREBBPQ92793 2442 aa3.61□□□□□ -1.83
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