RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 BAALCQ8WXS3 180 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 HIGD1BQ9P298 99 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 GAGE12JA6NER3 117 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 GAGE4Q13068 117 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 GAGE5Q13069 117 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 GAGE13Q4V321 117 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.97□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.96□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 ZMAT4Q9H898 229 aa14.96□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RFXAP-201ENST00000255476 E9PLD3 99 aa14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 K7ERJ3 54 aa14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 GCSHP23434 173 aa14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 RETNQ9HD89 108 aa14.95□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 A0A087WX48 190 aa14.94□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 CELA1Q9UNI1 258 aa14.94□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 MIFP14174 115 aa14.93□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.93□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.93□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 ETDBQ3ZM63 59 aa14.93□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.93□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 A8MZ25 164 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 LYRM9A8MSI8 78 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2D3P61077 147 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2D2P62837 147 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TIMM17AQ99595 171 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TM2D2Q9BX73 214 aa14.92□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.91□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 IGKCP01834 107 aa14.91□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.91□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TENM3Q9P273 2699 aa14.9□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 DPM2O94777 84 aa14.9□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM141Q96I45 108 aa14.9□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 PRO0461Q9UI25 63 aa14.9□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.9□□□□□ -0.02
RFXAP-201ENST00000255476 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 LINC01549A6NIU2 74 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 IGLL5B9A064 214 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 TSPAN13O95857 204 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 MTURNQ8N3F0 131 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 H3BMG7 143 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 F8VRH5 84 aa14.88□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 CEND1Q8N111 149 aa14.88□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 DAD1P61803 113 aa14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 PMVKQ15126 192 aa14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 FAM104AQ969W3 186 aa14.87□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.86□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.86□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.86□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.84□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.84□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 PLNP26678 52 aa14.84□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 CDIP1Q9H305 208 aa14.84□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 LINC00694P0DN24 101 aa14.83□□□□□ -0.03
RFXAP-201ENST00000255476 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.83□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 GYPEP15421 78 aa14.83□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.83□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 PRO0255Q9UI72 69 aa14.82□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0J9YY99 117 aa14.82□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 VCX2Q9H322 139 aa14.81□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf86A6NJI1 115 aa14.81□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 HTN3P15516 51 aa14.81□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 C12orf74Q32Q52 190 aa14.81□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.81□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 K7EIL1 84 aa14.8□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 SPINK8P0C7L1 97 aa14.8□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 FOXI1Q12951 378 aa14.8□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 Q6ZUT4 128 aa14.8□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 A0A096LPF7 62 aa14.79□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 PAX4O43316 350 aa14.79□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 ATP5G1P05496 136 aa14.79□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.79□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.79□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 APOMO95445 188 aa14.78□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 TAL2Q16559 108 aa14.78□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.78□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 F5H768 121 aa14.78□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 ERG28Q9UKR5 140 aa14.78□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 AMELXQ99217 191 aa14.77□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.77□□□□□ -0.04
RFXAP-201ENST00000255476 A0A1B0GWB2 263 aa14.77□□□□□ -0.05
RFXAP-201ENST00000255476 MT-ATP8P03928 68 aa14.77□□□□□ -0.05
RFXAP-201ENST00000255476 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms