RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.38□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 NIT1Q86X76 327 aa10.38□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.37□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.37□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WWL8 130 aa10.36□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 CTRLP40313 264 aa10.36□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 BAGE3Q86Y29 109 aa10.36□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 KLK12Q9UKR0 248 aa10.36□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.36□□□□□ -0.75
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SPCS1-201ENST00000233025 Q0VG73 95 aa10.34□□□□□ -0.75
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.34□□□□□ -0.75
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SPCS1-201ENST00000233025 UBE2D2P62837 147 aa10.33□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.32□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM18Q96B42 140 aa10.32□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.32□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WYN8 130 aa10.31□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 SSTP61278 116 aa10.31□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.31□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.3□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 SNAI2O43623 268 aa10.3□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 FABP4P15090 132 aa10.3□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.29□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 REG3GQ6UW15 175 aa10.29□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 RNF185Q96GF1 192 aa10.29□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.29□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.29□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WX48 190 aa10.28□□□□□ -0.76
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SPCS1-201ENST00000233025 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.28□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.28□□□□□ -0.76
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.27□□□□□ -0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 CHTF8P0CG12 524 aa10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf33Q8WU49 177 aa10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.27□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PPBPP02775 128 aa10.26□□□□□ -0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 ESDP10768 282 aa10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 MPV17L2Q567V2 206 aa10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ENHOQ6UWT2 76 aa10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ORMDL3Q8N138 153 aa10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.26□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CKS2P33552 79 aa10.25□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF56Q15929 161 aa10.25□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.25□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 AMN1Q8IY45 258 aa10.25□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CRCT1Q9UGL9 99 aa10.25□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 HSBP1O75506 76 aa10.24□□□□□ -0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 D6R8Y8 96 aa10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 AP1S3Q96PC3 154 aa10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.23□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM17P0DL12 118 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 RAB4AP20338 218 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PMCHP20382 165 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 AMTP48728 403 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 FA2HQ7L5A8 372 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf57Q99622 126 aa10.22□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM262E9PQX1 116 aa10.21□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.21□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 DPH3Q96FX2 82 aa10.21□□□□□ -0.77
SPCS1-201ENST00000233025 NUPR1O60356 82 aa10.2□□□□□ -0.78
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