RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ERG28Q9UKR5 140 aa13.13□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.13□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.13□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.13□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.13□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 TMEM89A2RUT3 159 aa13.11□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 IGHV3-33P01772 117 aa13.11□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 M0R2P5 195 aa13.11□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 B5MCH6 92 aa13.1□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 LINC00694P0DN24 101 aa13.1□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 COX6A2Q02221 97 aa13.1□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 CRLF1O75462 422 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 PDZD2O15018 2839 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 LITAFQ99732 161 aa13.09□□□□□ -0.31
PANX1-201ENST00000227638 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.08□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.08□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.07□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.07□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 SVIPQ8NHG7 77 aa13.07□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 Q6ZTI0 123 aa13.06□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.06□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 SNCGO76070 127 aa13.06□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 ZNF415Q09FC8 603 aa13.06□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 TMEM262E9PQX1 116 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 TRIAP1O43715 76 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE2BQ13066 116 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE2EQ4V326 116 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 CLEC2BQ92478 149 aa13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.04□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 ESM1Q9NQ30 184 aa13.04□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 RNF152Q8N8N0 203 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE5Q13069 117 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE6Q13070 117 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.03□□□□□ -0.32
PANX1-201ENST00000227638 GAGE12JA6NER3 117 aa13.02□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 GAGE4Q13068 117 aa13.02□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 PEMTQ9UBM1 199 aa13.02□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.02□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 LINC01620Q4KN68 170 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 TTC32Q5I0X7 151 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 CITED1Q99966 193 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 INSP01308 110 aa13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 STHQ8IWL8 128 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 CCDC179H3BU77 68 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 ATXN8Q156A1 80 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 Q8N2B8 174 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 TMEM101Q96IK0 257 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.99□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.98□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.98□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.97□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 C2orf82Q6UX34 121 aa12.97□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 Q9H8V8 135 aa12.97□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 A0A0B4J2C4 111 aa12.96□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.96□□□□□ -0.33
PANX1-201ENST00000227638 CCL24O00175 119 aa12.96□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 A8MTW9 85 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 GAGE7O76087 117 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 GAGE12FP0CL80 117 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 GAGE12GP0CL81 117 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 GAGE12IP0CL82 117 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 RS1O15537 224 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 IFITM1P13164 125 aa12.95□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.94□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 MIAQ16674 131 aa12.94□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 UBE2WQ96B02 151 aa12.94□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.94□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.93□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 C3orf56Q8N813 242 aa12.93□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.93□□□□□ -0.34
PANX1-201ENST00000227638 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.8 ms