RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vma21Q78T54 101 aa10.23□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr577Q8VH11 312 aa10.23□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btf3l4Q9CQH7 158 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cotl1Q9CQI6 142 aa10.23□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem139E9PX92 214 aa10.22□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxph4G3X9N5 304 aa10.22□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celsr2Q9R0M0 2920 aa10.22□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssbp3Q9D032 388 aa10.22□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa10.22□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mlst8Q9DCJ1 326 aa10.22□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pafah1b2Q61206 229 aa10.21□□□□□ -0.77
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfbpl1Q80W15 270 aa10.21□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qtnf4Q8R066 326 aa10.21□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1475Q8VEV6 314 aa10.21□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MmdQ9CQY7 238 aa10.21□□□□□ -0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav17A0A075B655 113 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2al1jA2BFR3 109 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr715bE9Q725 315 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn1aP39689 159 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem52bQ0VBF2 186 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam168aQ8BGZ2 244 aa10.21□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AplnrQ9WV08 377 aa10.21□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnd6P03925 172 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccl2P10148 148 aa10.2□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Evi2aP20934 223 aa10.2□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav6n-5A0A075B621 112 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1458A0A1L1SSD5 307 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10073E9Q3T0 114 aa10.2□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rom1P32958 351 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf125Q9D9R0 233 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArtnQ9Z0L2 224 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa10.2□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 eef1akmt3D3YWP0 232 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thap8E9Q695 213 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb2a2J3KMP9 96 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F7P70375 446 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd200r3Q5UKY4 296 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem190Q9D2E9 166 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr959Q9EQ86 311 aa10.2□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncoa6Q9JL19 2067 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P04941 107 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdlim4P70271 330 aa10.19□□□□□ -0.78
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb2b24Q7M747 112 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam19a2Q7TPG7 131 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r222Q8R269 308 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OtogO55225 2910 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15127B1AVZ5 449 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15091B1AZM2 449 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp708F8VPP0 541 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ascl5M0QWB7 188 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1102Q8VES2 324 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr87Q99MT7 358 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col7a1Q63870 2944 aa10.19□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D930048N14RikA2AA67 225 aa10.18□□□□□ -0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casp6O08738 276 aa10.18□□□□□ -0.78
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